Departamento del Chocó:  El sistema hidrográfico del departamento del Chocó es uno de los más abundantes e interesantes del país. Siendo de gran importancia los ríos

• Atrato
• San Juan
• Baudó

también son importantes los ríos:

• Andágueda
• Jampavadó
• Bebará
• Bebaramá
• Bojayá
• Docampadó
• Domingodó
• Munguidó
• Opogodó
• Quito
• Salaquí
• Sucio
• Tanela

Departamento del Cauca: 

• Rio Timbiquí